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gromasc文件介绍
文件介绍四:mdp文件介绍(nvt)
GROMACS NVT 模拟的 .mdp 文件介绍 在分子动力学模拟中,NVT(恒体积恒温)模拟是一种常见的模拟类型,主要用于维持系统的温度,并在恒定体积下进行模拟。在 ...
文件介绍四:mdp文件介绍(能量最小化)
GROMACS 能量最小化 .mdp 文件的介绍和使用 在 GROMACS 中,能量最小化(Energy Minimization)是分子模拟中非常重要的一步,它的目的是通过减少系统的势能,...
文件介绍三:top和itp(补充)
1 添加和定义原子信息在 GROMACS .top 文件中的方法 在 GROMACS 中,.top 文件用于定义整个模拟系统的拓扑,包括分子、原子、键、角度、二面角等信息。对于使...
文件介绍三:top和itp力场文件介绍
TOP 和 ITP 文件介绍 在分子动力学模拟(如 GROMACS)中,TOP 文件和ITP 文件是描述力场参数和分子拓扑结构的关键文件。它们分别用于定义全局和局部的拓扑信...
文件介绍二:gromacs安装目录下的文件介绍
1 安装目录下的力场文件 在win系统下,如果使用的是已经编译好的安装包路径如下 gmx2020.6_AVX2_CUDA_win64\gmx2020.6_GPU\share\gromacs\top 在linux...
文件介绍一:gro和pdb(格式要求严格,建议了解下)
在分子模拟中,gro 和 pdb 文件是两种常见的分子结构文件格式,它们用于存储分子结构的原子坐标、化学信息和拓扑结构。下面是它们的简要介绍: 1. GRO 文件...